La colocación quirúrgica de una sonda de alimentación (sonda G, sonda GY o sonda Y) se realiza en el quirófano mientras el paciente está bajo anestesia general. La sonda de alimentación se coloca directamente a través de la pared del estómago y termina en el estómago (sonda G) o en el intestino delgado (sonda GY). La sonda de yeyunostomía (Y) se coloca directamente a través de la pared del intestino. Por lo general, estas sondas son dispositivos de bajo perfil o botones. Si inicialmente se coloca una sonda larga, puede que se la reemplace con un dispositivo después de que el tracto cicatrice en el plazo de 6 semanas.

La cirugía puede ser mínimamente invasiva (laparoscópica) con muchas incisiones pequeñas o abierta, utilizando una incisión más grande. En la cirugía laparoscópica, se inserta una cámara pequeña para guiar el procedimiento. En un procedimiento abierto, se hace una incisión más grande a través de la pared abdominal para acceder al estómago o el intestino.